Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fermt1P59113 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms