Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdrg1P59048 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms