Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad23bP54728 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad23bP54728 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms