Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacnb3P54285 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacnb3P54285 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms