Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClgnP52194 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 396.2 ms