Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl5P50228 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms