Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BckdhaP50136 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdhaP50136 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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