Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CitP49025 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CitP49025 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms