Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf2P39429 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf2P39429 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms