Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn1P35821 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms