Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr2P35343 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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