Protein–RNA interactions for Protein: P32211

Chrm4, Muscarinic acetylcholine receptor M4, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm4P32211 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chrm4P32211 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms