Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou3f3P31361 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms