Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc11P31313 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc11P31313 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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