Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprmP28828 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprmP28828 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprmP28828 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprmP28828 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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