Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RxraP28700 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxraP28700 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxraP28700 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RxraP28700 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxraP28700 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxraP28700 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxraP28700 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxraP28700 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxraP28700 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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RxraP28700 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxraP28700 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxraP28700 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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