Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Marcksl1P28667 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms