Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CftrP26361 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CftrP26361 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CftrP26361 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CftrP26361 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CftrP26361 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CftrP26361 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CftrP26361 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CftrP26361 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CftrP26361 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CftrP26361 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CftrP26361 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CftrP26361 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CftrP26361 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CftrP26361 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CftrP26361 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CftrP26361 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CftrP26361 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CftrP26361 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CftrP26361 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CftrP26361 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CftrP26361 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CftrP26361 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CftrP26361 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CftrP26361 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CftrP26361 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CftrP26361 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CftrP26361 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CftrP26361 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CftrP26361 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CftrP26361 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CftrP26361 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CftrP26361 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CftrP26361 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CftrP26361 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CftrP26361 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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