Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms