Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RarbP22605 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RarbP22605 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RarbP22605 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RarbP22605 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RarbP22605 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RarbP22605 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RarbP22605 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RarbP22605 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RarbP22605 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms