Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkcaP20444 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms