Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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