Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms