Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim30aP15533 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim30aP15533 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms