Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms