Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z5

Putative UPF0730 protein encoded by LINC00643 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C1Z5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P0C1Z5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P0C1Z5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P0C1Z5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms