Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01648 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01648 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01648 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01648 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms