Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01641 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01641 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01641 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01641 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01641 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01641 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01641 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01641 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms