Protein–RNA interactions for Protein: O89020

Afm, Afamin, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfmO89020 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AfmO89020 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AfmO89020 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AfmO89020 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AfmO89020 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AfmO89020 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AfmO89020 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AfmO89020 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AfmO89020 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AfmO89020 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AfmO89020 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AfmO89020 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AfmO89020 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms