Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShdO88834 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ShdO88834 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ShdO88834 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms