Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
JtbO88824 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
JtbO88824 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
JtbO88824 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
JtbO88824 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
JtbO88824 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
JtbO88824 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
JtbO88824 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
JtbO88824 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms