Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms