Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Dnmt3bO88509 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Dnmt3bO88509 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Dnmt3bO88509 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnmt3bO88509 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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