Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AurkcO88445 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AurkcO88445 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.7 ms