Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfdp1O88271 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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