Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xirp1O70373 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms