Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms