Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkbO55229 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms