Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1baO35930 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gp1baO35930 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gp1baO35930 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1baO35930 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1baO35930 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1baO35930 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1baO35930 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1baO35930 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gp1baO35930 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms