Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Clk4O35493 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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