Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf5O35445 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf5O35445 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf5O35445 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf5O35445 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf5O35445 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rnf5O35445 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rnf5O35445 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rnf5O35445 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rnf5O35445 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rnf5O35445 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rnf5O35445 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf5O35445 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rnf5O35445 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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