Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kpna3O35344 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms