Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RrhO35214 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RrhO35214 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RrhO35214 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RrhO35214 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RrhO35214 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RrhO35214 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RrhO35214 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RrhO35214 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RrhO35214 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RrhO35214 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RrhO35214 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RrhO35214 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RrhO35214 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RrhO35214 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RrhO35214 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RrhO35214 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
RrhO35214 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RrhO35214 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RrhO35214 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RrhO35214 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RrhO35214 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RrhO35214 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RrhO35214 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RrhO35214 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RrhO35214 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RrhO35214 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RrhO35214 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RrhO35214 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RrhO35214 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms