Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
U90926O08546 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
U90926O08546 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
U90926O08546 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
U90926O08546 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
U90926O08546 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
U90926O08546 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
U90926O08546 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
U90926O08546 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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U90926O08546 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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U90926O08546 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
U90926O08546 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
U90926O08546 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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