Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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