Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms