Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm3415J3QMS8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm3415J3QMS8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm3415J3QMS8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm3415J3QMS8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm3415J3QMS8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm3415J3QMS8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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