Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21411J3KMS0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms