Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
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Taf4bG5E8Z2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Taf4bG5E8Z2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms