Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp17ldG5E8G2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms